Hépatite C. Fraction LDL VLP. Flaviviridae Hepacivirus ssrna (+), 1 segment enveloppe + VLP. VLP délipidées. Virions libres avec enveloppe

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1 Fraction LDL VLP Hépatite C Flaviviridae Hepacivirus ssrna (+), 1 segment enveloppe + VLP VLP délipidées Virions libres avec enveloppe André P. et al.,j Virol 76 (2002) 6919 Petit M-A et al., Virology 336 (2005) 144

2 HCV polyprotéine précurseur «core» capside p21 E1 env gp31 E2 env gp70 p7 * NS2 Cys protéase p21 * NS3 p70 Ser protéase Hélicase NS4A Ser protéase cofacteur p6 NS4B * Exocytose? p27 NS5A réponse à l IFN-α? pp58 / Zn2+ NS5B * RNA-dep. RNA pol. p68 A HVR1 B A +H 3 N COO * Intrinsic membrane protein A : Ser phosphorylated B : Arg methylated : activity of the NS2-NS3 protease requires NS3 protease as a structural domain, but not the Ser protease activity itself. Also requires Zn 2+ Unknown protease (signal peptidase?) Signal peptidase NS2-NS3 métallo/cystéine protéase NS3 sérine protéase

3 Diagnostic sérologique de l hépatite C Tests de dépistage des anti-hcv (EIA) de format indirect ne détectent que les Ac IgG. Tests de dépistage des anti-hcv (EIA) de format «sandwich» détectent les Ac de toutes classes.. Contrairement au cas de HIV, les Ac IgM n apparaissent pas plus tôt que les Ac IgG. HAV, HBV (anti-hbc), HIV

4 Anti-HCV : EIAs de dépistage en «sandwich» de 3ème génération Ag : protéines recombinantes ou peptides synthétiques P (Roche électrochémiluminescence) Ac IgG S P (Roche électrochémiluminescence) Ac IgM S

5 HCV polyprotéine précurseur «core» capside p21 E1 env gp31 HVR1 E2 env gp70 p7 NS2 Cys protéase p21 NS3 p70 Ser protéase Hélicase NS4A Ser protéase cofacteur p6 NS4B Exocytose? p27 NS5A réponse à l IFN-α? p58 NS5B RNA-dep. RNA pol. p68 + H 3 N COO SOD SOD SOD AxSYM 3.0 gén. 1a Roche Elecsys , 1a + 1b mtnf b INNO- LIA Score

6 Tests de dépistage HCV de «3ème génération» spécificité < 100 % p. ex % de faux positifs reproductibles au LIA en 2002 parmi les dosages de routine

7 1. Streptavidine 2. Anti-h IgG (3+) 3. h IgG (1+) 4. h IgG (±, cutoff) IgG anti-hcv : test de confirmation Nég. Ind. Pos C1 C2 E2* NS3 NS4 NS5A *HVR-1 Pos.

8 Hépatite C la RT-PCR a un rôle dans le diagnostic aiguë avec résolution spontanée Rechercher l ARN de HCV et doser l ALT plusieurs fois pendant au moins 12 mois (Alberti A et al., J Hepatol 38 (2003) S104) aiguë chronique Disparition spontanée de l ARN de HCV : 0.5 % par année Watanbe H. et al. J Med Virol 71 (2003) 56

9 Smyk-Pearson S. et al., J Inf Dis 197 (2008) 46 Chronic Resolved

10 Profil d immunodot HCV indéterminé 4 diagnostics à envisager en fonction de la clinique et de la biochimie : (1) Séroconversion (hépatite C aiguë) : rechercher l ARN de HCV par PCR immédiatement (ou répéter la sérologie quelques semaines plus tard). (2) Séroréversion (hépatite C guérie) : répéter la sérologie tous les 12 mois. L ARN de HCV est négatif. (3) Hépatite C chronique : rechercher l ARN de HCV par PCR. Avant d écarter une hépatite C chronique, il faut au minimum 2 PCR négatives (si possible 3), à 6 mois d intervalle (si possible), en raison des possibles fluctuations de la virémie. (4) Réaction(s) croisée(s) ou non-spécifique(s) : répéter la sérologie dans 6 mois. L ARN de HCV est négatif.

11 Hépatites B et C aiguës : cinétique de la virémie et de la réponse immune CTL Bertoletti A et Ferrari C, Hepatology 38 (2003) 4

12 Détection de la phase précoce de l infection à HCV Symptômes ALT ~ 50 jours (41 85) Apparition retardée chez toxicomanes, immunodéprimés, HIV+, etc* HCV Ac EIA HCV ARN RT-PCR ARN détectable entre 7 et 25 jours après l'infection Temps (jours) infection

13 Détection de la phase précoce de l infection à HCV Symptômes ALT ~ 50 jours (41 85) Apparition retardée chez toxicomanes, immunodéprimés, HIV+, etc* HCV Ac EIA HCV NC Ag EIA HCV ARN RT-PCR ARN détectable entre 7 et 25 jours après l'infection Temps (jours)

14 Ag HCV qualitatif (Ortho) vs HCV RNA par RT-PCR (Monitor Roche) en cas d hépatite C aiguë Retard de la détection de l Ag HCV par rapport à l ARN (jours) 2 (0 10) Sensibilité de l EIA Ag HCV par rapport à la RT- PCR Publication Couroucé et al., Transfusion 40 (2000) (0 4) 94.2 % Icardi et al., J Clin Microbiol 39 (2001) (2 - > 21) 65.9 % Grant et al., Transfusion 42 (2002) 1032 Le seuil de détection de l'ag HCV correspond à une virémie de ~ 1 x 10 5 UI/ml

15 EIA pour l antigène de nucléocapside («core») négatif réactif Test de confirmation sérologique (neutralisation) positif (vrai positif) négatif f(aux positif)

16 EIA pour l antigène de nucléocapside («core») négatif réactif Test de confirmation sérologique (neutralisation) RT-PCR positif (vrai positif) négatif f(aux positif)

17 HCV : génotypes (nouvelle classification) Divergence inter-génotypes : 31 % - 34 % des nucléotides différents Divergence inter-subtypes : 20 % - 23 % des «" (au sein d un même génotype) :

18 HCV : génotypes Simmonds P., J Gen Virol 82 (2001)

19 Génotypes de HCV au niveau mondial Kuiken, C. et al. Nucl. Acids Res :D512-D516; doi: /nar/gkm962

20 Génotypes HCV dans la région de Marseille, toxicomanes i.v. génotype 1a : 2.85 x plus probable qu'un autre non toxicomanes i.v. génotype 1b : 2.35 x plus probable qu'un autre dialysés génotype 2 particulièrement fréquent région Paris Nord-Est foyer de prévalence élevée du génotype 4 Tamalet C. et al., J Med Virol 71 (2003) 391

21 Régions de l ARN viral transcrites en cdna et amplifiées pour la détermination du génotype choix de sites de liaison des amorces dans des régions conservées d un génotype à l autre partie interne des produits amplifiés différent d un génotype à l autre ARN de HCV protéines

22 HCV : détermination du génotype par hybridation en dot à des sondes spécifiques Noppornpanth S et al., J Clin Micr 44 (2006) 3969 Méthode alternative : séquençage des régions 5 -UTR et/ou NS5

23 Co-infection par 2 génotypes différents Pas exceptionnelle, notamment chez des toximanes i.v. Recombinaison de virus appartenant à 2 génotypes différents Rare, contrairement à HIV - 2k / 1b NS2 St. Petersbourg (2002) - 2i / 6p NS2-NS3 Vietnam (2006) - 2b / 1b NS3 Philippines (2006) - 2x / 5x NS2-NS3 France, Sud-Ouest (2007)

24 HCV RNA Valeurs usuelles Max. : ~ 1.6 x 10 8 copies/ml (J Levis et al, J Clin Virol 20 (2001) FIG. 3. Dynamic change in serum HCV RNA levels determined by COBAS HCM-2 before and at 2 and 4 weeks after initiation of IFN-α treatment for 8 complete responders and 22 nonresponders. Black circles linked by bold lines represent complete responders. Solid dots linked by regular lines represent nonresponders.