La photographie et l ichtyologie

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1 La phtgraphie et l ichtylgie MRAC Musée ryal de l Afrique centrale Frmatin FishBase et la Taxinmie des Pissns Sessin 2014

2 Index A. L imprtance des phts dans le dmaine de l ichtylgie B. Avant de cmmencer C. Prendre des phts dans le lab D. Prendre des phts sur le terrain E. Les phts dans FishBase F. Mrphmétrie gémétrique MRAC Musée ryal de l Afrique centrale Frmatin FishBase et la Taxinmie des Pissns Sessin 2014

3 A. L imprtance des phts dans le dmaine de l ichtylgie «une illustratin vaut mieux que mts» Lutjanus greensis - Première identificatin (famille > genre > espèce) caractéristiques distinctifs (frme du crps, nageires, barbillns, culeur, buche, lèvres, ) Victr Mamnekene Sleil Wamuini MRAC sciences cityennes (IUCN BiBlitz) - Différentes techniques: clrants rayns X mrphmétrie gémétrique - Facile à partager, transprter et stcker - Aspect visuel dans article scientifique, pster, présentatin, Mastacembelus seiteri Artedius harringtni Adam Summers Emmanuel Vreven Musée ryal de l Afrique centrale Frmatin FishBase et la Taxinmie des Pissns Sessin 2014

4 B. Avant de cmmencer - savir utiliser sn appareil pht et dnc lire le mde d empli - ser de srtir du mde tut autmatique et cmprendre le rôle de: l uverture du diaphragme (la valeur f/) la vitesse d expsitin la sensibilité ISO la fnctin macr lifeissavage.cm bnplanpht.fr MRAC Règles empiriques: bien prendre sin de sn matériel ne jamais effacer les phts riginales et tujurs faire une sauvegarde des phts tujurs faire en srte de savir quelles phts crrespndent à quel spécimen emplyer un cde unique pur nmmer les phts sur l rdinateur (cllectin, lcalité, date, ) prendre pht du côté latéral (flanc gauche!), drsal et ventral prévir une échelle si pssible (papier millimétrique, règle, ) éviter l empli du flash (réflexins, cnsmmatin d énergie sur le terrain, ) phts de haute qualité = mins de phts par carte mémire Musée ryal de l Afrique centrale Frmatin FishBase et la Taxinmie des Pissns Sessin 2014

5 C. Prendre des phts dans le lab - Matériel appareil pht statif fnd uni (essuie, tile, table, ) épingles pincette essuie échelle (papier mm, règle, ) carnet MRAC - Imprtant MRAC lumière naturelle (pas en plein sleil) tampnner spécimen pur éviter réflexins prendre une série de phts avec différentes vitesses d expsitin/ uverture diaphragme emplyer un cde unique pur phts: MRAC P b Syntype MNHN c Bien nter si vus mdifier qqchse à la pht (culeur, cntraste, encadrement, ) et ne jamais utiliser le nm riginal pur une pht mdifiée! MRAC MRAC Musée ryal de l Afrique centrale Frmatin FishBase et la Taxinmie des Pissns Sessin 2014

6 D. Prendre des phts sur le terrain - Avantages: culeurs, frme, nageires, - Matériel appareil pht (statif) cuvette/petit aquarium pur spécimens vivants fnd uni (essuie, tile, table, ) pur spécimens mrts échelle, essuie, - Imprtant sélectinner spécimens en bnne état différentes tailles si pssible étendre nageires phts détaillées (barbillns, tête, nageires, ) prévir assez de piles, cartes de mémire et chargeurs étiqueter utiliser flash seulement si indispensable MRAC MRAC MRAC Musée ryal de l Afrique centrale Frmatin FishBase et la Taxinmie des Pissns Sessin 2014

7 Musée ryal de l Afrique centrale Frmatin FishBase et la Taxinmie des Pissns Sessin 2014

8 Cherchez les fautes Musée ryal de l Afrique centrale Frmatin FishBase et la Taxinmie des Pissns Sessin 2014

9 E. Les phts dans FishBase - envirn phts dans FishBase pictgrammes des familles, dessins, phts en culeur, timbres, Clarteidae Chrysichthys macrpterus - les phts snt très ppulaires - le but est, pur chaque espèce, d avir: Pll (1967) un dessin mrphlgique une pht d un spécimen mrt une pht aquarium u un dessin avec culeurs vifs une pht dans l envirnnement naturel - Cmment cntribuer? juin aût 2009 Musée ryal de l Afrique centrale Frmatin FishBase et la Taxinmie des Pissns Sessin 2014

10 Page de présentatin d espèce Musée ryal de l Afrique centrale Frmatin FishBase et la Taxinmie des Pissns Sessin 2014

11 Musée ryal de l Afrique centrale Frmatin FishBase et la Taxinmie des Pissns Sessin 2014

12 Gnathnemus petersii MRAC/Musscht Mrmyridae Musée ryal de l Afrique centrale Frmatin FishBase et la Taxinmie des Pissns Sessin 2014

13 Musée ryal de l Afrique centrale Frmatin FishBase et la Taxinmie des Pissns Sessin 2014

14 F. Mrphmétrie gémétrique - Discipline scientifique pur étudier et analyser la frme d une structure - Méthde: définir des pints d intérêt sur les structures étudiées, seln le but recherché marquer les pints au myen de repères Mrphmétrie traditinelle Mrphmétrie gémétrique relever les crdnnées, en 2D u en 3D, sit directement dans un lgiciel si l n travaille sur des images, sit directement sur l bjet en 3D Y X Musée ryal de l Afrique centrale Frmatin FishBase et la Taxinmie des Pissns Sessin 2014

15 F. Mrphmétrie gémétrique - éliminer les effets d échelle grâce au calcul de la distance prcrustéenne u à l aide des crdnnées de Bkstein, ce qui autrise enfin la réalisatin de cmparaisns bjectives des frmes étudiées Musée ryal de l Afrique centrale Frmatin FishBase et la Taxinmie des Pissns Sessin 2014

16 Musée ryal de l Afrique centrale Frmatin FishBase et la Taxinmie des Pissns Sessin 2014

17 F. Mrphmétrie gémétrique - calcul de la distance prcrustéenne: éliminatin de l échelle (taille), lcalité (translatin) et rtatin Y Musée ryal de l Afrique centrale Frmatin FishBase et la Taxinmie des Pissns Sessin 2014 X

18 F. Mrphmétrie gémétrique - calcul de la distance prcrustéenne: eliminatin de l échelle (taille), lcalité (translatin) et rtatin Y Musée ryal de l Afrique centrale Frmatin FishBase et la Taxinmie des Pissns Sessin 2014 X

19 F. Mrphmétrie gémétrique - Calcul du cnsensus: frme myenne Musée ryal de l Afrique centrale Frmatin FishBase et la Taxinmie des Pissns Sessin 2014

20 F. Mrphmétrie gémétrique - Cnsensus pur tris ppulatins d une espèce Musée ryal de l Afrique centrale Frmatin FishBase et la Taxinmie des Pissns Sessin 2014

21 F. Mrphmétrie gémétrique - Analyse en cmpsantes principales sur les crdnnées après calcul de la distance prcrustéenne des specimens de tris ppulatins: Musée ryal de l Afrique centrale Frmatin FishBase et la Taxinmie des Pissns Sessin 2014

22 F. Mrphmétrie gémétrique - Visualisatin des résultats: Musée ryal de l Afrique centrale Frmatin FishBase et la Taxinmie des Pissns Sessin 2014

23 F. Mrphmétrie gémétrique - Avantages: relativement simple: mettre des pints sur des phts digitales plus de dnnées sur la gémétrie capturée et analysée en réduisant le nmbre de variables Visualisatin des différences entre espèces, ppulatins, etc. - Désavantages: sélectin, définitin et applicatin exacte des repères hmlgues (avec des effets de cnservatin des spécimens, tissues dux, etc.) analyse de crdnnées, pas de mesures allmétrie: infrmatin de la taille des spécimens est entièrement absent malgré sn imprtance bilgique Musée ryal de l Afrique centrale Frmatin FishBase et la Taxinmie des Pissns Sessin 2014

24 - En savir plus? Méthde dévelppée à l Université Stne Brk à New Yrk (SUNY) (chercher SUNY» sur Articles, livres, présentatins de Dany Spencer Adams, F. James Rhlf, Dennis E. Slice, etc. Musée ryal de l Afrique centrale Frmatin FishBase et la Taxinmie des Pissns Sessin 2014