Détection des Escherichia coli producteurs de shiga-toxines

Transcription

1 Détection des Escherichia coli producteurs de shiga-toxines Sadjia Bekal Ph. D. 20 octobre Québec 3 novembre Montréal

2 Objectifs de la présentation 1. Comprendre la nomenclature des sérotyopes de E. coli 2. Comprendre la notion de pathotypes chez E. coli 3. Situer le groupe STEC parmi les autres pathotypes 4. Constater la différence entre la recherche de O157:H7 (en routine actuellement) et les autres E. coli producteurs de shiga-toxines (voie du futur) 5. Pouvoir juger la pertinence de la recherche des E. coli producteurs de shiga-toxines 2

3 Escherichia coli E. coli est un bacille à Gram négatif, oxydase négative Membre de la famille Enterobacteriaceae (> 30 genres, >140 espèces) Nomenclature antigénique: Antigènes somatiques (paroi) O Antigènes flagellaires H Ex. O157:H7, O104:H4 Antigènes capsulaires (ex. K1, K12) 3

4 Escherichia coli Hôte normal du tube digestif de l homme et des animaux Retrouvé dans l environnement (témoin de contamination fécale) La majorité des souches sont non pathogènes E. coli possède une grande plasticité du génome lui permettant d acquérir des éléments génétiques (facteurs de virulence) : Ilots de pathogénicité Pouvoir pathogène 4

5 Pouvoir pathogène et pathotypes Infections extra-intestinales Infections urinaires (UPEC) Méningites néonatales (MENEC) Infections génitales Infections puerpérales Infections de plaies (nosocomiales) Infections ostéo-articulaires Bactériémies

6 Pouvoir pathogène et pathotypes Infections intestinales (diarrhéiques) En fonction des facteurs de virulence on distingue 6 pathotypes: Entéropathogènes (EPEC) E. coli à adhésion diffuse (DAEC) Entérotoxinogènes (ETEC) Entéroinvasifs (EIEC) Entéroaggrégatifs (EAggEC) Vérocytotoxinogènes (VTEC, STEC)

7 Pathotypes diarrhéiques DAEC Adhésion diffuse Aida ETEC «Turista» Entérotoxines LT et ST EPEC LEE EHEC O157 SHU VTEC STEC stx EIEC Pénétration épithélium Dysentériforme EAggEC Diarrhées persistantes Adhésion Entérotoxine EAST Donnenberg, 2002, modifié

8 STEC : définitions E. coli capables de produire des toxines similaires à celles de Shigella dysenteriae type 1, appelées: Shiga-like toxin (SLT) ou Vérocytotoxines (VT) : toxicité sur les cellules Véro ou Shiga-toxines (Stx) Les STEC ne sont pas toutes associées à des infections chez l homme.

9 STEC versus EHEC Les STEC capables de causer des colites hémorragiques chez l homme sont appelées souches entéro-hémoragiques (EHEC). Les EHEC : produisent des shiga-toxines (Stx1 et/ou Stx2) adhèrent aux cellules épithéliales et effacent les micro-villosités. Les infections à E. coli producteurs de shiga-toxines sont à déclaration obligatoire au Québec et sous surveillance nationale au Canada

10 Sérotypes EHEC fréquemment rencontrés O22:H5 O22:H8 O26:NM O26:H11 O28:H25 O45:H2 O55:H7 O84:NM O88:H25 O91:NM O91:H14 O91:H21 O103:H2 O104:H21 O111:NM O111:H2 O111:H8 O113:H21 O118:H2 O118:H12 O118:H16 O119:NM O119:H4 O119:H25 O121:H19 O128:NM O128:H2 O128:H45 O145:NM O146:H21 O153:H2 O153:H25 O157:NM O157:H 7 O165:NM O165:H25 O172:NM O174:H21 O174:H28 O104:H 4

11 Recherche et identification de O157:H7 Selle Colonie Sorbitol négative Agglutination avec l anti-sérum O157 Confirmation du E. coli Confirmation et EGCP* * Électrophorèse sur gel en champs pulsé

12 Sérotypes STEC fréquemment rencontrés O22:H5 O22:H8 O26:NM O26:H11 O28:H25 O45:H2 O55:H7 O84:NM O88:H25 O91:NM O91:H14 O91:H21 O103:H2 O104:H21 O111:NM O111:H2 O111:H8 O113:H21 O118:H 2 O118:H12 O118:H16 O119:NM O119:H4 O119:H25 O121:H19 O128:NM O128:H2 O128:H45 O145:NM O146:H21 O153:H2 O153:H25 O157:NM O157:H7 O 65:NM O165:H25 O172:NM O174:H21 O174:H28 O104:H4

13 Que s est passé avec le O104:H4 en Europe? La souche est sorbitol positif Stx 1 négative Stx 2 positive Absence du locus attachement-effacement Présence du plasmide des EAggEC

14 E. coli O104:H4 LEE stx AAF EPEC EHEC O157 VTEC STEC EAggEC Cible commune Toxine Stx

15 Recherche des STEC non-o157 - PCR - Culture de cellules Véro - Dosage immunologique (EIA) Selle Enrichissement en bouillon MacConkey Recherche de shigatoxines Bouillon Stx + Sérotypage (O et H) EGCP Isolement du E. coli stx + MMWR, 2009; 58 (RR12):1-14

16 Algorithme proposés pour les laboratoires cliniques Selle Colonies sorbitol négatives Recherche de Shiga-toxines Agglutination O157 positive Bouillon stx + et O157 négatif Souche O 157 Laboratoire de référence MMWR, 2009 / 58(RR12);1-14

17 Tests immunologiques disponibles pour la détection des STEC Trousse Compagnie Cible Spécimen Sensibilité (%) Immunocard STAT!EHEC Meridian Diagnostics Inc. Stx1, stx2 -Bouillon -Isolats Spécificité (%) Premier EHEC Meridian Diagnostics Inc. stx -Selles -Bouillon -Isolats ProSpecT STEC Remel stx - Selles - Bouillon - Selles dans milieu de transport (Cary-Blair) Ces valeurs sont celles données par le manufacturier Les laboratoires devraient évaluer la performance de ces trousses avant leurs implantations Des tests de compétences sont disponibles au College of American Pathologists

18 Conclusions

19 Avantages de la recherche des STEC O157 et non-o157 Identification rapide de l agent étiologique Diminution des coûts de suivi du patient Investigation améliorée des éclosions Surveillance plus exhaustive des agents de colites Données sur la distribution des sérotypes STEC Meilleure compréhension des mécanismes de contamination des aliments Effets bénéfiques sur la salubrité des aliments Intervention de santé publique

20 Limites actuelles à la détection des STEC non-o157 Absence de consensus Accessibilité et coûts des tests Modifications des pratiques actuelles Diversité des approches Recherche peut être fastidieuse (isolement) Peu de données disponibles sur l incidence des diarrhées à E. coli STEC au Canada 20

21 «Si vous conduisez et vous rencontrez un virage, prenez-le!» Merci!