Rencontres du Club Jeune de la Société Française

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1 Ecole de Printemps de la Société Française aise de Spectrométrie trie de Masse XII èmes Rencontres du Club Jeune de la Société Française aise de Spectrométrie trie de Masse À Saint Dié des Vosges Strasbourg: les ponts couverts et la cathédrale Photo: JMS Organisateurs : LSMBO

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3 Liste des participants 2007 Karim Arafah Lab. de Neuro-immunologie des Annélidés. FRE CNRS 2933 USTL, Bat SN3, porte 113 Cité Scientifique Villeneuve d'ascq Didier Arl LSMCL 1 Bd Arago METZ arl@univ-metz.fr Cédric Atmanène Laboratoire de Spectrométrie de Masse Bio-Organique ECP, Bâtiment R5 25, Rue Becquerel Strasbourg catmanene@chimie.ustrasbg.fr Laurent Badoil Anjou Recherche Chemin de la Digue Maisons-Laffitte laurent.badoil@veolia.com Aïcha Bagag Laboratoire de Spectrométrie de Masse ICSN / CNRS Avenue de la Terrasse Gif-sur-Yvette Cedex bagag@icsn.cnrs-gif.fr Ludovic Bailly-Chouriberry LCH 15, rue de Paradis Verrière le Buisson bailly@vet-nantes.fr Dominique Baiwir Université de Liège Allée de la Chimie, 3 Bat. B6c LSM-CART B-4000 Liège (BELGIQUE) D.Baiwir@ulg.ac.be Dorothée Balbeur Université de Liège Allée de la Chimie, 3 Bat. B6c LSM-CART B-4000 Liège (BELGIQUE) dbalbeur@ulg.ac.be Nicolas Barthen LSMCL 1 Bd Arago METZ barthen@univ-metz.fr Sigrid Baumgarten SSFMB (LCSOB) UPMC, UMR 7613 Case courier Paris Cedex 05 sigrid@ccr.jussieu.fr Guillaume Bechade Laboratoire de Spectrométrie de Masse Bio-Organique ECP, Bâtiment R5 25, Rue Becquerel Strasbourg gbechade@chimie.u-strasbg.fr Audrey Bednarczyk Laboratoire de Spectrométrie de Masse Bio-Organique ECP, Bâtiment R5 25, Rue Becquerel 67087Strasbourg abednar@chimie.u-strasbg.fr Claudia Bich ETH Zurich - HCI D325 WolfgangPauliStrasse Zurich Suisse bich@org.chem.ethz.ch

4 Claire Bouchut INRA-UMR SPO bât place Viala Montpellier Cedex 1 bouchut@ensam.inra.fr Matthieu Bounichou CIMMA 2, Bd Lavoisier Angers Cedex 01 mathtieu@hotmail.com Brice Bouyssière LCABIE CNRS UMR 5254 LCABIE Helioparc 2 av Pr Angot Pau cedex Brice.Bouyssiere@univ-pau.fr Cédric Bovet ETH Zurich - HCI D325 WolfgangPauliStrasse Zurich Suisse bovet@org.chem.ethz.ch Ludovic Canelle IPBS-CNRS 205 route de Narbonne Toulouse Cedex 04 canelle@ipbs.fr Guilhem Caumette LCABIE CNRS UMR 5254 LCABIE Helioparc 2 av Pr Angot Pau cedex guilhem.caumette@etud.univpau.fr Cyril Colas DCMR Ecole Polytechnique Route de Saclay PALAISEAU cedex cyril.colas@wanadoo.fr Mike Collodoro Université de Liège Allée de la Chimie, 3 Bat. B6c LSM-CART B-4000 Liège (BELGIQUE) mike.collodoro@student.ulg.a c.be Frédérique Courant LABERCA Route de gachet BP Nantes cedex 3 courant@vet-nantes.fr David Da Silva LSMCL 1 Bd Arago METZ david.cours@gmail.com Delphine Debois Laboratoire de Spectrométrie de Masse ICSN / CNRS Avenue de la Terrasse Gif-sur-Yvette Cedex delphine.debois@icsn.cnrsgif.fr Christelle Deleuze Université de Liège Allée de la Chimie, 3 Bat. B6c LSM-CART B-4000 Liège (BELGIQUE) cdeleuze@ulg.ac.be Véronique Delval-Dubois Laboratoire de Spectrométrie de Masse Bio-Organique ECP, Bâtiment R5 25, Rue Becquerel Strasbourg vdelval@chimie.u-strasbg.fr Kevin Demeure Université de Liège Allée de la Chimie, 3 Bat. B6c LSM-CART B-4000 Liège (BELGIQUE) K.Demeure@ulg.ac.be

5 Caroline Desbans SSFMB (LCSOB) UPMC, UMR 7613 Case courier Paris Cedex 05 Blandine Destrez LABERCA Route de gachet BP Nantes cedex 3 destrez@vet-nantes.fr Moussa Diaby DCMR Ecole Polytechnique Route de Saclay PALAISEAU cedex abdoulkadre@hotmail.com Hélène Diemer Laboratoire de Spectrométrie de Masse Bio-Organique ECP, Bâtiment R5 25, Rue Becquerel Strasbourg hdiemer@chimie.u-strasbg.fr Rowan Dobson Université de Liège Allée de la Chimie, 3 Bat. B6c LSM-CART B-4000 Liège (BELGIQUE) rdobson@ulg.ac.be Magalie Duchateau DCMR Ecole Polytechnique Route de Saclay PALAISEAU cedex m.duchateau@yahoo.fr Mohamed El Ayed Lab. de Neuro-immunologie des Annélidés. FRE CNRS 2933 USTL, Bat SN3, porte 113 Cité Scientifique Villeneuve d'ascq elayedm@yahoo.fr Junien Exposito LSMCL 1 Bd Arago METZ exposito@univ-metz.fr Johann Far LCABIE CNRS UMR 5254 LCABIE Helioparc 2 av Pr Angot Pau cedex johann.far@etud.univ-pau.fr Maximilien Fleron Université de Liège Allée de la Chimie, 3 Bat. B6c LSM-CART B-4000 Liège (BELGIQUE) m.fleron@student.ulg.ac.be Laetitia Fouillen Laboratoire de Spectrométrie de Masse Bio-Organique ECP, Bâtiment R5 25, Rue Becquerel Strasbourg lfouillen@chimie.u-strasbg.fr Gilles Frache LSMCL 1 Bd Arago METZ frache@univ-metz.fr Julien Franck Lab. de Neuro-immunologie des Annélidés. FRE CNRS 2933 USTL, Bat SN3, porte 113 Cité Scientifique Villeneuve d'ascq julien-franck@neuf.fr Sébastien Gallien Laboratoire de Spectrométrie de Masse Bio-Organique ECP, Bâtiment R5

6 25, Rue Becquerel Strasbourg Cyril Guerandel LSMCL 1 Bd Arago METZ c.guerandel@cric.be François Guillonneau Université Paris 5 22 rue Mechain Paris fguillon@infobiogen.fr Caroline Gurcel Université Lyon 1 bât. CPE, 43 bd. Du 11 novembre Villeurbanne cedex caroline.gurcel@cpe.fr Grégory Hamm LSMCL 1 Bd Arago METZ hamm@univ-metz.fr Paul Hannewald LSMCL 1 Bd Arago METZ hannewald@univ-metz.fr Julie Hardouin L.B.P.P. Université Paris 13 74, rue Marcel Cachan Bobigny Cedex hardouin@smbh.univparis13.fr Laetitia Heudt Université de Liège Allée de la Chimie, 3 Bat. B6c LSM-CART B-4000 Liège (BELGIQUE) laetitia.heudt@ulg.ac.be Agnès Hovasse Laboratoire de Spectrométrie de Masse Bio-Organique ECP, Bâtiment R5 25, Rue Becquerel Strasbourg ahovasse@chimie.u-strasbg.fr Laure Joly LASIM bât 205, 43 bd. Du 11 novembre Villeurbanne cedex ljoly@lasim.univ-lyon1.fr Saïd Kinani DCMR Ecole Polytechnique Route de Saclay PALAISEAU cedex said@dcmr.polytechnique.fr Catherine Kinet Université de Liège Allée de la Chimie, 3 Bat. B6c LSM-CART B-4000 Liège (BELGIQUE) ckinet@ulg.ac.be Stéphanie Kirsch Université de Liège Allée de la Chimie, 3 Bat. B6c LSM-CART B-4000 Liège (BELGIQUE) s.kirsch@ulg.ac.be Clotilde Le Vot SSFMB (LCSOB) UPMC, UMR 7613 Case courier Paris Cedex 05 c.levot@free.fr Sabrina Lignon IBSM CNRS 31 chem J. Aiguier Marseille Cedex 20 lignon@ibsm.cnrs-mrs.fr

7 Matthieu Loriau SSFMB (LCSOB) UPMC, UMR 7613 Case courier Paris Cedex 05 Marie-Laure Lortz Laboratoire de Spectrométrie de Masse Bio-Organique ECP, Bâtiment R5 25, Rue Becquerel Strasbourg Marlène Marcellin CEA Grenoble 17, rue des Martyrs Grenoble Cedex 9 marlene.marcellin@cea.fr Mariette Matondo IPBS-CNRS 205 route de Narbonne Toulouse Cedex 04 mariette.matondo@ipbs.fr Marie-Anne Maubert SSFMB (LCSOB) UPMC, UMR 7613 Case courier Paris Cedex 05 mamaubert@yahoo.fr Gabriel Mazzucchelli Université de Liège Allée de la Chimie, 3 Bat. B6c LSM-CART B-4000 Liège (BELGIQUE) mike.collodoro@student.ulg.a c.be Emmanuelle Meudec INRA-UMR SPO bât place Viala Montpellier Cedex 1 meudec@ensam.inra.fr Rayane Mohamed Nestlé Research Center Vers-chez-les-Blanc Quality&Safety Dpt 2000 Lausanne 26 rayane.mohamed@rdls.nestle. com Karine Pionnier SSFMB (LCSOB) UPMC, UMR 7613 Case courier Paris Cedex 05 karine.pionnier@hotmail.fr Loïc Quinton Université de Liège Allée de la Chimie, 3 Bat. B6c LSM-CART B-4000 Liège (BELGIQUE) loic.quinton@ulg.ac.be Johan Riga Université de Liège Allée de la Chimie, 3 Bat. B6c LSM-CART B-4000 Liège (BELGIQUE) johan.riga@student.ulg.ac.be Nicolas Smargiasso Université de Liège Allée de la Chimie, 3 Bat. B6c LSM-CART B-4000 Liège (BELGIQUE) nsmargiasso@ulg.ac.be Jonathan Stauber Lab. de Neuro-immunologie des Annélidés. FRE CNRS 2933 USTL, Bat SN3, porte 113 Cité Scientifique Villeneuve d'ascq stauberjonathan@yahoo.fr Nora Tahallah Laboratoire de Spectrométrie de Masse

8 ICSN / CNRS Avenue de la Terrasse Gif-sur-Yvette Cedex tahallah@icsn.cnrs-gif.fr David Touboul ETH Zurich - HCI D325 WolfgangPauliStrasse Zurich Suisse toubouldavid@hotmail.fr Sandrine Voillard SSFMB (LCSOB) UPMC, UMR 7613 Case courier Paris Cedex 05 voillard@ccr.jussieu.fr Maxence Wisztorski Lab. de Neuro-immunologie des Annélidés. FRE CNRS 2933 USTL, Bat SN3, porte 113 Cité Scientifique Villeneuve d'ascq maxence.wisztorski@free.fr Ying Xu SSFMB (LCSOB) UPMC, UMR 7613 Case courier Paris Cedex 05 xu@ccr.jussieu.fr

9 XII èmes rencontres du Club Jeunes de la Société Française de Spectrométrie de Masse Programme détaillé Lundi 19 mars h30 : Départ du bus de la gare de Strasbourg pour Saint-Dié 17h15 : Accueil des participants 18h15-19h15 : Conférences industrielles 18h15 : Nouveaux outils en protéomiques : la préparation d échantillon (techniques de déplétion), l analyse (spectrométrie de masse) et l étude des interactions (puces anticorps) N. Chabrier, Sigma 18h45 : Environnement et agroalimentaire, L. Beyet, Applied Biosystems 19h05 : Présentation du LCMS-IT-TOF et ses applications, J. Pruvost, Shimadzu Mardi 20 mars 2007 Modérateur : Delphine Debois, Gif-sur-Yvette, France 08h30 10h30 : 10h30 11h00 : 11h00 12h20 : Histoire de la spectrométrie de masse, par Olivier Laprévote, ICSN, Gif-sur-Yvette. Pause café Analyse de petites molécules et stéroïdes 11h00 : Analysis of contaminant in Food-Evaluation of MIP before LC-MS/MS, R. Mohamed, P.A. Guy 11h20 : Effets stéréochimiques des dérivés en position 11 du 17-β-oestradiol, S. Voillard, F. Fournier, Jacquot, C. Afonso, Leclercq, JC Tabet 11h40 : Stratégie analytique pour la mesure de traces d hormones stéroïdes, F. Courant, J.P. Antignac, D. Maume, F. Monteau, F. Andre, B. Le Bizec 12h00 : Analyse de la 17-β-boldénone sulfate simultanément par LC-MS/MS et LC- HRMS, B. Destrez, F. Monteau, J.P. Antignac, L. Rambeau, E. Bichon, B. Le Bizec 12h20 : Etude par FTICRMS des métabolites secondaires de la vigne, G. Hamm, B. Maunit, JF. Muller 12h20-14h00 : Repas

10 Modérateur : David Touboul, Zurich, Suisse 14h00-16h00 : 16h00 16h30 : 16h30-18h10 : Thermochimie (1/2), par Guy Bouchoux, DCMR, Ecole Polytechnique, Palaiseau. Pause café Instrumentation et développement 16h30 : Attribution de l origine des explosifs par l analyse FT/MS, S. Baumgarten, D. Lesage, M. Barbe-Leborgne, JC. Tabet 16h50 : Ambient mass spectrometry using Desorption Electrospray ionization, L. Heudt, B. Gilbert, E. De Pauw 17h10 : Top-Down proteomics using matrix enhanced ISD, K. Demeure, L. Quinton, V. Gabelica, E. De Pauw 17h30 : Créneau conférence industrielle 4 Mercredi 21 mars 2007 Modérateur : Laetitia Fouillen, Strasbourg, France 08h30-10h30 : 10h30 11h00 : 11h00 12h20 : Thermochimie (2/2), par Guy Bouchoux, DCMR, Ecole Polytechnique, Palaiseau. Pause café Interactions protéines-ligands ; Echange isotopique 11h00 : Identification de disrupteurs endocriniens par MS, C. Bovet, M. Ruff, A. Nazabal, D. Moras, R. Zenobi 11h20 : Etude de complexes non-covalents Leucotoxines/Calixarènes par ESMS, C. Atmanène, D. Keller, G. Prevost, S. Sanglier, A. Van Dorsselaer 11h40 : Liaison anticorps-antigène étudiée par MALDI-MS, C. Bich, A. Nazabal, R. Wenzel, R. Zenobi 12h00 : Echange H/D en phase gazeuse de petits oligonucléotides, D. Balbeur, E. De Pauw 12h20-14h00 : Repas Modérateur : Loïc Quinton, Liège, Belgique 14h00-16h00 : 16h00 16h30 : Spectrométrie de masse quantitative (1/2), par Edwin De Pauw, LSM-CART, Université de Liège, Belgique. Pause café

11 16h30-18h10 : Analyse de peptides et de protéines 16h30 : Obtention de peptides microbiens à partir de l hémoglobine, V. Dubois-Delval, N. Nedjar-Arroume, M. Kouach, G. Briand, D. Guillochon 16h50 : Répétabilité des analyses nanolc-ms/ms en protéomique, G. Béchade, L. Mauvieux, L. Miguet, S. Sanglier, A. Van Dorsselaer 17h10 : Absolute quantification of targeting proteins using LC-ID-MS/MS, S. Kirsch, J. Widart, E. De Pauw 17h30 : Détection de l administration illégale d hormone de croissance équine, L. Bailly- Chouriberry, Y. Bonnaire, B. Le Bizec 17h50 : Détection de protéines O-Glycosylées via la «click chemistry», C. Gurcel, J. Lemoine, A.S. Vercoutter 18h10 : Spectrométrie de masse et applications cliniques, P.O. Schmit, Bruker Daltonics Jeudi 22 mars 2007 Modérateur : Mariette Matondo, Toulouse, France 08h00 10h00 : 10h00 10h30 : 10h30 12h30 : 12h20-14h00 : 14h00-20h00 : 20h00 : Spectrométrie de masse quantitative (2/2), par Edwin De Pauw, LSM-CART, Université de Liège, Belgique. Pause café L ionisation Electrospay, par Carlos Afonso, Université Pierre et Marie Curie, Paris. Repas Après-midi Détente Dîner de Gala à La Bolle Vendredi 23 mars 2007 Modérateur : Ying Xu, Paris, France 08h30 10h30 : 10h30 11h00 : 11h00 12h20 : L analyseur Temps de vol, par Isabelle Fournier, USTL, Villeneuve d Ascq. Pause café Analyse et métaux 11h00 : Protocole d identification des composés du Mn par LA-MS, J. Exposito, F. Aubriet 11h20 : Spéciation du Se dans la levure par 3D-LC-MS, J. Far, M. Dernovics, H. Peud hommes, R. Lobinski

12 11h40 : Etude ESI-FT-ICR-MS de thiophénolates de Chalogenures de Zn et de Cd, D. Arl, F. Aubriet, J.J. Gaumet 12h00 : Analyse de métaux dans les produits pétroliers par µfia-icp-ms, G. Caumette, C.P. Lienemann, I. Merdrignac, B. Bouyssière, R. Lobinski 12h40-13h : 13h00-14h00 : 14h30 : Clôture des XII èmes rencontres du Club jeunes de la SFSM Repas Départ du bus pour la gare de Strasbourg

13 Nouveaux Outils en Protéomique La préparation d échantillon Les fluides biologiques sont des sources prometteuses pour la découverte des bio marqueurs de maladies. Cette analyse est rendue difficile à cause de la gamme très large de concentrations en protéines (10 log) et à cause du fait que les bio marqueurs sont présents en concentrations très faibles. Le kit ProteoPrep R 20 permet la dépletion la plus complète (20 protéines) et la plus efficace (97-98% des protéines) parmi les solutions actuellement disponibles. L analyse : La protéomique est passée de la phase de découverte à la phase d analyse quantitative. La technique de quantification absolue Aqua TM utilise des peptides marqués pour quantifier de façon absolue les protéines par Spectrométrie de Masse. Cette technique est développée par Dr. Steve Gygi et ses collègues du Harvard Medical School [Stemmann O, Zou H, Gerber SA, Gygi SP, Kirschner MW; Dual inhibition of sister chromatid separation at metaphase, Cell 2001, Dec 14, 107: ]. Nous vous montrons quelques examples concrets de quantification du niveau de phosphorylation ou du niveau de silencing induit par sirna. L étude des interactions : Les puces anticorps permettent de donner le profil d expression de protéines d un échantillon de référence par rapport à un autre échantillon. Cette approche complète l analyse de données issues de l utilisation de puces d expression génomiques. Les puces anticorps sont également des outils très prometteurs pour étudier des maladies comme le cancer parce que la croissance, l invasion et les métastases sont le résultat du fonctionnement anormal de protéines de la signalisation cellulaire. Une première puce représentant les différentes voies de signalisation, le Panorama TM Antibody Microarray Cell Signaling kit, a été développée par Sigma-Aldrich il y a 2 ans. Depuis la gamme s est élargie des puces anticorps plus ciblées : une puce kinase et une autre pour étudier la régulation des gènes. Une nouvelle génération de puces est maintenant également disponible: il s agit de puces avec des protéines recombinants fonctionnelles. Le Panorama TM Human Functional Cancer Microarray contient 129 protéines humaines qui jouent un rôle dans le cancer. Le contenu a été publié par Michael R. Stratton a& collègues du the Wellcome Trust Sanger Institute, Hinxton, UK.

14 Présentation du LCMS-IT-TOF & applications Jacques Pruvost SHIMADZU France, 65 avenue du Général de Gaulle, Champs sur Marne. Tél jp@shimadzu.fr Le LCMS-IT-TOF est un nouveau type de spectromètre de masse hybride développé par SHIMADZU. Pour sa conception, les chercheurs SHIMADZU se sont basés sur leur grande expérience de la technique du Temps de Vol, consacrée par le prix Nobel de Chimie 2002 de Mr Koichi TANAKA pour ses travaux en MALDI-TOF au sein de SHIMADZU. Le LCMS- IT-TOF est un instrument destiné à la découverte de biomarqueurs, l identification de métabolites, la recherche médicale, et il est aussi idéal pour le développement en synthèse organique, en particulier les principes actifs, et pour des applications en environnement et en médico-légale. Le LCMS-IT-TOF consiste en un couplage des technologies de Trappe d Ions (IT) et de Temps de Vol (TOF), il offre ainsi la masse exacte et la haute résolution en fragmentation MS n (n 10). Ainsi, en une seule analyse, ce couplage donne accès à un plus grand nombre d informations qualitatives sur l échantillon. Le LCMS-IT-TOF permet aux chercheurs : -d élucider les structures de nouvelles molécules, -d identifier des impuretés et des contaminants, -d analyser des métabolites et des biomarqueurs, Le développement du LCMS-IT-TOF a été orienté dans le but de maximiser la sensibilité et la sélectivité en optimisant le transfert des ions vers le TOF et en améliorant les performances de la Trappe d Ions. La Trappe est utilisée pour la focalisation des ions avant éjection dans le TOF et pour réaliser la fragmentation MSn avec une sélection précise de l ion précurseur. Le LCMS-IT-TOF est unique en son genre et regroupe un grand nombre d innovations et d améliorations technologiques : -Compressed Ion Injection (Brevet Shimadzu), -Ballistic Ion Extraction (Brevet Shimadzu), -Dual-Stage Reflectron (Brevet Shimadzu), -Nouvelle optique de transfert des ions, -Contrôle de temperature du TOF pour une stabilité sur plusieurs jours, Les interfaces d ionisation à pression atmosphérique, le système de désolvatation et le Q- Array sont ceux déjà utilisés avec succès pour la LCMS SHIMADZU. En combinant des technologies innovantes, le LCMS-IT-TOF élargit les possibilities de la spectrométrie de masse en proposant l accès à des techniques inédites répondant aux besoins analytiques les plus complexes.

15 Club Jeuncs de la Societe Frangaise de Spectrometrie de Masse Xllemes Rencontres et Ecole de Printemps / St-Die du 19 au 23 mars Titre (66c) : Resume de la communication orale (20 minutes de presentation avec les questions) A envoyer avant le l er fevrier 2007 adelphine.debois@icsn.cnrs-gif.fr Analysis of contaminant in Food-Evaluation of MIP before LC-MS/MS Auteurs (66c) RMohamed, PA Guy Organismes : (66 ex 3) Nestle Research Center, Lausanne, Switzerland MIP Technologies, Lund, Sweden University Pierre and Marie Curie, Paris, France Resume : (1914 c) Chemical contaminants represent a wide range of compounds that can be found at trace levels in food matrices. These contaminants usually come from the human agricultural practices (i.e. pesticides or veterinary drugs) or can occur naturally (mycotoxins). The analysis of chemical contaminants in food (raw materials) generally entails three main steps: sample preparation, analytical measurement and data processing. Sample preparation is often considered as the bottleneck step as it is tedious, time and solvent consuming. Classically, it involves solubilisation, liquid/liquid extraction, centrifugation, solid phase extraction, evaporation, solubilisation. In order to reduce such labor intensive work, the use of molecularly imprinted polymer (MIP) has been evaluated before LC-MS/MS analysis. Three applications will be presented such as the selective extraction of 1) chloramphenicol in milk, 2)1 nitroimidazoles in egg and 3) 13-agonists in beef liver samples. Thus, the advantages and disadvantages of MIP approach will be discussed from a unique; targeted compound (chloramphenicol), a closely related chemical structure family (7 nitroimidazoles) and finally a larger class of compounds with relatively spread chemical! structure(22b-agonists). MOHAMED Prenom : Rayane Organisme : Adresse : Nestle Research Center, Quality and Safety Dept Vers-Chez-Les-Blanc Code postal : 1000 Ville : Lausanne, Switzerland

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27 XIIèmes Rencontres et Ecole de Printemps St-Dié du 19 au 23 mars 2007 Club Jeunes de la Société Française de Spectrométrie de masse Résumé de la communication orale (20 minutes de présentation avec les questions) A envoyer avant le 08 février 2007 à delphine.debois@icsn.cnrs-gif.fr Titre (66c) : Obtention de peptides antimicrobiens à partir de l'hémoglobine Auteurs (66c) : Dubois-Delval V, Nedjar-Arroume N, Kouach M, Briand G,Guillochon D Organismes :(66 c x 3) : Laboratoire ProBioGEM- IUT A-USTL-Lille I et Laboratoire d Application de Spectrométrie de Masse-Faculté de Médecine-Lille II Résumé :(1914 c) : L hémoglobine a été décrite par Ivanov et al., (1997), comme une source endogène de peptides actifs. L hydrolyse de ses chaînes α et β, engendre des peptides présentant des activités biologiques diverses telles que solubilisatrice de l héme, opioïde, analgésique... Des peptides antimicrobiens ont également été isolés de l hémoglobine, par hydrolyse chimique ou enzymatique (Fogaça et al., 1999, Parish et al., 2001, Froidevaux et al., 2001). L objectif de cette étude est de générer de nouveaux peptides antimicrobiens à partir de l hydrolyse enzymatique de l hémoglobine bovine. Celle a été menée en conditions dénaturantes (urée 6M), dans du tampon acétate de sodium 0,1M à ph 4,5 et à 23 C, avec un rapport E/S de 1/11 (mole/mole). Les peptides antimicrobiens étant généralement des peptides de grande taille (Toke, 2005), l hydrolyse a été stoppée à un temps très court (2,5 minutes) correspondant à un degré d hydrolyse faible (DHc 3%), permettant l obtention de peptides intermédiaires de grande taille susceptibles de présenter une activité antimicrobienne. L activité antimicrobienne de cet hydrolysat a été testée sur 10 souches bactériennes. Celui-ci s est révélé actif vis-à-vis de 4 souches bactériennes : Micrococcus luteus A270, Listeria innocua, Escherichia coli et Salmonella enteritidis. Après fractionnement par CLHP en phase inverse, vingt six fractions ont été obtenues et testées. Parmi celles-ci, neuf fractions se sont montrées actives vis-à-vis des quatre souches bactériennes. Après identification par spectrométrie de masse de ces fractions, cinq d entre elles se sont révélées pures et correspondent aux peptides α , α , α , α , et β Après avoir récupéré les peptides purs en grande quantité par CLHP à l échelle semi-préparative, leur CMI, leur mode d action, leur effet hémolytique ainsi que quelques propriétés structurales ont été déterminés.

28 Résumé Communication orale Rencontres du Club Jeunes SFSM 2007 Titre : Répétabilité des analyses nanolc-ms/ms en protéomique. Auteurs : G. Béchade*, L. Mauvieux, S. Sanglier*, A. Van Dorsselaer* Organismes : *Laboratoire de Spectrométrie de Masse Bio-Organique, IPHC - DSA, Strasbourg, France Institut d'hématologie et d'immunologie, ULP, Strasbourg, France Résumé : La recherche de nouveaux bio-marqueurs potentiels par analyse protéomique en spectrométrie de masse est rendue difficile par la complexité des mélanges protéiques à étudier et la faible quantité de matériel souvent disponible. En outre, les stratégies d analyse différentielle par nanolc-ms/ms présentent un caractère aléatoire intrinsèque lié à la sélection des ions pour la MS/MS et à la durée d'un cycle MS+MS/MS. Cela implique une perte d information importante. Or, le succès de la découverte de nouveaux marqueurs spécifiques de pathologies ou de nouvelles cibles thérapeutiques dépend directement de la capacité de la méthode à fournir l image la plus complète du contenu protéique de l échantillon. Dans ce contexte, le bénéfice apporté par la répétition de l analyse d un même échantillon peut être déterminant. En effet, avec nos couplages nanolc Q/TOF et LCmicrofluidique piège à ions, nos résultats montrent que de 2 à 4 analyses successives peuvent être nécessaires pour connaître 90% du contenu protéique global identifiable d un échantillon issu d un gel d électrophorèse 1-D. Avec à ces considérations, de nouvelles stratégies d analyse, associées à des critères d identification adaptés, pourront apporter une efficacité plus grande dans la recherche différentielle de bio-marqueurs potentiels par spectrométrie de masse. BECHADE Guillaume Laboratoire de Spectrométrie de Masse Bio-Organique, IPHC, DSA ECPM - 25 rue Becquerel Strasbourg

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30 Détection de l administration illégale d hormone de croissance équine Ludovic BAILLY-CHOURIBERRY 1,2, Yves BONNAIRE 2, Bruno Le BIZEC 1 1 LABERCA, École Nationale Vétérinaire de Nantes, route de Gachet BP 50707, Nantes ; 2 Laboratoire des Courses Hippiques, 15 rue de Paradis, Verrières le Buisson L hormone de croissance équine recombinante (rest) est une protéine de 22 kda produite par génie génétique qui se différencie de la forme naturelle uniquement par l addition d une méthionine en position N-terminale. L utilisation de cette molécule dans le cadre des courses hippiques (performance) ou en production animale (croissance) est strictement réglementée par le code des courses et les directives de sécurité des aliments en vigueur, respectivement. Or, il n existe pas à l heure actuelle de méthode directe fiable de détection de cette molécule pour appliquer la réglementation. Par conséquent, le challenge analytique est de développer une méthode de mesure suffisamment sensible et spécifique de cette molécule présente à l état de trace (1 à 10 µg.l -1 ) dans les matrices biologiques complexes (sang, urine). Dans ce travail, des étapes d extraction, de purification de protéines sont réalisées incluant : la précipitation sélective au sulfate d ammonium, l extraction en phase solide (SPE). Après digestion enzymatique, les peptides trypsiques de l hormone recombinante purifiée sont concentrés avant d être analysés par LC-ESI-MS n. Cette nouvelle méthode de détection basée sur l hydrolyse enzymatique et l identification grâce à la LC-ESI-MS n du peptide N-terminal caractéristique de l hormone de croissance équine recombinante nous a permis de détecter un ajout de rest à 10 µg.l -1 dans le plasma. Les étapes principales de la méthode seront abordées comme par exemple les conditions de précipitation, le choix des cartouches SPE et les différents analyseurs de masse utilisés lors du développement méthodologique (QqQ, piège à ions 3D, piège à ions linéaire).

31 Titre : Détection de protéines O-glycosylées via la «click chemistry» Auteurs : Caroline Gurcel [a], Jérôme Lemoine [a], Anne-Sophie Vercoutter [b] Organismes : [a] Université Claude Bernard Lyon 1, UMR 5180, Laboratoire des Sciences Analytiques [b] Université des Sciences et Technologies de Lille, UMR 8576, Unité de Glycobiologie Structurale et Foncionnelle Résumé : La O-glycosylation des protéines est une des modifications post-traductionnelles dynamiques les plus abondantes dans les cellules eucaryotes. Cette modification joue un rôle fondamental dans la régulation de l activité protéique ; une anomalie peut entraîner des pathologies graves comme le diabète, la maladie d Alzheimer ou des cancers. Une détection, ainsi qu une identification spécifiques de ces protéines serait d un grand intérêt pour mieux comprendre la régulation de cette modification post-traductionnelle. Nous avons mis au point une stratégie pour détecter les protéines O-glycosylées ; elle est basée sur l utilisation d une variante de la cycloaddition 1,3-dipolaire de Huisgen entre un alcyne terminal et un groupement azido, catalysée par du cuivre(i) pour former un triazol stable. Cette réaction chimique, appelée «click chemistry», représente un outil puissant pour l analyse biologique, car elle s effectue en tampon aqueux compatible avec les milieux biologiques et les groupements chimiques intervenant sont quasi-inertes vis-à-vis des fonctions retrouvées dans le vivant. Nous avons synthétisé dans nos laboratoires des analogues de la glucosamine avec un groupement azido ou alcyne, ainsi que des sondes biotinylées comportant elles aussi ces fonctions chimiques. Une étude cinétique «en solution» par chromatographie en phase liquide (phase inverse) couplée à un spectromètre de masse (ionisation electrospray) a montré que cette réaction entre un glucose fonctionnalisé et la sonde appropriée était rapide et complète dans des conditions similaires à celles utilisées dans le marquage protéique. Des tests in vitro ont également été menés avec nos composés. Après incorporation cellulaire des sucres modifiés, les protéines sont extraites et marquées par l addition de la spécifiquement, par affinité entre le groupement biotine des sondes et la streptavidine marquée à la peroxidase. Ces premiers résultats sont concluants, et les travaux en cours visent à purifier ces protéines O-glycosylées afin de les identifier et de localiser leurs sites de O-glycosylation.

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33 Club Jeunes de la Société Française de Spectrométrie de Masse XIIèmes Rencontres et Ecole de Printemps / St-Dié du 19 au 23 mars Titre (66c) : Résumé de la communication orale (20 minutes de présentation avec les questions) A envoyer avant le 1 er février 2007 à delphine.debois@icsn.cnrs-gif.fr Spéciation du Se dans la levure par 3D-LC-MS Auteurs (66c) Johann Far, Mihaly Dernovics, Hugues Preud homme, Ryszard Lobinski Organismes : (66 c x 3) Equipe de Chimie Analytique Bio-inorganique et Environnement, IPREM - UMR CNRS, 2, avenue du Président Pierre Angot, Hélioparc Pau Pyrénées, Pau Résumé : (1914 c) En plus de son caractère essentiel chez l homme, le sélénium est aussi connu pour ses vertus anti oxydantes et anti cancéreuse lorsqu il est administré sous forme organique à des doses supérieures à son essentialité. Une faible teneur en sélénium dans le sol est souvent corrélée à des carences plus ou moins sévères en cet oligo-élément dans les populations humaines. La levure Saccharomyces cerevisiae est utilisée comme source complémentaire de sélénium organique, soit directement administrée aux populations humaines, soit ajoutée à l alimentation animale destinée à la consommation humaine, parce qu elle peut tolérer et produire de grande quantité de biomolécules organiques séléniées à partir de sélénium inorganique. Ces biomolécules séléniées produites sont plus facilement assimilable par l homme et l animal mais aussi beaucoup moins toxique que sa forme inorganique. Par contre, elles ne possèdent pas toutes le même pouvoir anti oxydants ou anti cancéreux. La teneur en sélénium totale dans cette levure est connue mais sa spéciation reste toujours largement inconnue. Les techniques analytiques utilisées à ce jour ne sont pas suffisamment efficaces pour séparer et identifier la grande variété de molécules organiques séléniées présentes. Ceci a incité notre laboratoire à développer de nouvelles méthodes basées sur des techniques de chromatographies liquides multidimensionnelles couplées à la spectrométrie de masse élémentaire et moléculaire. La puissance analytique ainsi déployée permet l obtention de fractions séléniées suffisamment pures pour identifier ces molécules et compléter le bilan de masse en sélénium encore incomplet à ce jour. Nom : Far Prénom : Johann Organisme : Adresse : Equipe de Chimie Analytique Bio-inorganique et Environnement, IPREM - UMR CNRS/UPPA avenue du Président Pierre Angot, Hélioparc Pau Pyrénées Code postal : Ville : Pau Cedex